211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4313 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  246  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  35.71 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  32.17 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  34.78 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  35.83 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.78 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  30.36 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  38.04 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  41.24 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  32.74 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  36.11 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  33.63 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  27.19 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  31.19 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  36.84 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  25.89 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  35.71 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  33.62 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  32.17 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  31.9 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  32.74 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.09 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  31.58 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  30.3 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  36.17 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  39.22 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  35.59 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  32.77 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  30.43 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  32.38 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  31.73 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  29.57 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  31.93 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  36.56 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  31.25 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  29.82 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  28.57 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  25 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  25.23 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  29.46 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  40.68 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  25 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  28.18 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  25.23 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  25 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  30.51 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  26.36 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  28.07 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  30.33 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  30.51 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  27.68 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  29.46 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  30 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  29.31 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  32.76 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  29.06 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  31.82 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  27.96 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  27.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  25.21 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  27.73 
 
 		 389 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  29.31 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  29.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  30 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  29.17 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  31.03 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  29.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  33.63 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  29.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  29.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  24.79 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  31.73 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  27.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  30.51 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  27.68 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  29.57 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  32.2 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  31.97 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  28.85 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  34.15 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  30.63 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>