93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2366 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 115 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  39.82 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  40.86 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  32.65 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  32.04 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  37.5 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  31.58 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  29.46 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  32.74 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  33.67 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  29.79 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  37.04 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  29.57 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  48.94 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  35.63 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  46 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3610  hypothetical protein  28.18 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  33.03 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  35.63 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  34.26 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  34.23 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  38.55 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  42.55 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  38.55 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  38.55 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  35.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  32.73 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  34.48 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  30.21 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  36.36 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  46.81 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  31.36 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  44.68 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  28.05 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  34.95 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  29.51 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  32.04 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  23.89 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  44.68 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  36 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  38.3 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  33.33 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  38.3 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  29.51 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  26.09 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  29.31 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  28.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  30.53 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  35.71 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  29.03 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  29.03 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  30.09 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  34.31 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  36.47 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  25 
 
 		 135 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  27.43 
 
 		 136 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  46.81 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  31.19 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  40.43 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  28.18 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  32 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  31.19 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  31.19 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  31.19 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  29.51 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  40.43 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  34.12 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  38.46 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  29.13 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  32.18 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  33.03 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  27.1 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  33.03 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  58.82 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  30.69 
 
 		 160 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  32.67 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  26.13 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  27.5 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  30.91 
 
 		 120 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  25.62 
 
 		 121 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>