231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2428 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  80.74 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  80 
 
 		 135 aa  228  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  82.09 
 
 		 135 aa  226  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  77.78 
 
 		 135 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  77.78 
 
 		 135 aa  217  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  77.78 
 
 		 135 aa  217  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  76.47 
 
 		 136 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  78.12 
 
 		 135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  75 
 
 		 136 aa  209  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  77.17 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  76.19 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  66.67 
 
 		 135 aa  183  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  68.15 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  60.61 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  54.48 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  58.4 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  50.75 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  53.12 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  45.93 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  45.11 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  42.54 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  42.96 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  42.42 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  39.81 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  36.97 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  39.8 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  34.23 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  37.04 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  40.19 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  40.19 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  34.78 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  36.75 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  34.95 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.33 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  35.14 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  36.44 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  37.3 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  40 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  37.11 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  38.1 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  37.17 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  38.54 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  37.04 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  38.78 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  32.73 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  40.38 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  44.29 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  39.6 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  33.96 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  33.33 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  37.89 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  43.84 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  38.78 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  38.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  36.89 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  38.24 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  40.62 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  38.24 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  38.14 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  33.07 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  38.83 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  38.24 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  38.24 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  45.71 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  39.25 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  42.05 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  35.96 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  34.65 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  31.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  32.71 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  39.25 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  39.25 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  39.25 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.56 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36.11 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  39.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  34.09 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  35.51 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  34.04 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  39.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  34.91 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.96 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  32.28 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  40.3 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  30.08 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.87 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  29.25 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>