198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1110 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  71.67 
 
 		 123 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  65.85 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  62.81 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  62.6 
 
 		 124 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  63.41 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  62.6 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  63.64 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  60.66 
 
 		 124 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  58.68 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  63.03 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  53.78 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  51.67 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  56.2 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  52.94 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  40.52 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  41.67 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  40.18 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  34.13 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  38.46 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  38.83 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  36.44 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  41.03 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  31.9 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  34.23 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  31.9 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  37.29 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  37.07 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  37.82 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  40.19 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.43 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.96 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  46.05 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  37.1 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  39.83 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  36.52 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  30.77 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  38.83 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  36.52 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  38.83 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  39.81 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  34.78 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  33.91 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  43.02 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  36.84 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  51.81 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  39.33 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  40.35 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  39.08 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  46.15 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  38.61 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  34.91 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  33.64 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  37.78 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  48.53 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  54.41 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  35.92 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  35.92 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  49.18 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  41.77 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  34.34 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  41.11 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  46.38 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  40.79 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  34.51 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  47.56 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  31.15 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  41.33 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  43.02 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  32.2 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  50 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  45.21 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  34.44 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  40 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  38.1 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  41.33 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  46.27 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  32.79 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  37.63 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  35.71 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  31.62 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  41.79 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  36.62 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  40 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>