217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2918 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  100 
 
 
136 aa  277  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  87.5 
 
 
136 aa  248  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  76.69 
 
 
136 aa  216  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  76.47 
 
 
135 aa  212  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  74.26 
 
 
135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  76.47 
 
 
135 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  77.42 
 
 
132 aa  204  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  72.79 
 
 
135 aa  203  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  72.06 
 
 
135 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  72.06 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  72.06 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  66.91 
 
 
135 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  70.59 
 
 
160 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  65.44 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  60 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  57.78 
 
 
136 aa  157  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  57.94 
 
 
136 aa  149  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  57.14 
 
 
129 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  54.26 
 
 
136 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  48.85 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  42.75 
 
 
132 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  43.31 
 
 
146 aa  94  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  42.75 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  34.85 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  40 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  34.65 
 
 
122 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  32.82 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  40.28 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  38.24 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  40.74 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  33.59 
 
 
123 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.13 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  30.97 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  35.51 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.59 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  35.92 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  37.89 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  35.85 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  34.11 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  31.68 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  39.77 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  34.29 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  30.84 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  33.64 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  37.89 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  37.89 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  37.89 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  40.28 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  33.98 
 
 
133 aa  53.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  37.76 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  37.89 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  35.4 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  38.71 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  29.6 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  37.37 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  31.3 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  34.95 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  32.95 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  36.14 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  29.63 
 
 
117 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  32.67 
 
 
122 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  36.14 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  43.28 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  29.69 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  33.7 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  33.98 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  34.58 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  36.76 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  34.55 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  40.26 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  34.21 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  34.62 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  36.14 
 
 
122 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  37.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  31.11 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  31.07 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.78 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  32.38 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  33.98 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  32.58 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36.96 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  34.74 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  28.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  31.08 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
389 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>