248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0955 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  48.65 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  46.55 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  43.22 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  44.83 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  43.97 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  43.1 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  42.48 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  42.61 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  42.61 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  42.61 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  42.61 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  40.87 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  41.53 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  41.23 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  41.38 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  41.23 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  40.17 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  38.79 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  42.11 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  38.79 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.26 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  36.61 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  40.35 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  38.26 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  38.26 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  39.47 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.29 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  39.64 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  39.82 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  36.97 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.61 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  42.86 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  36.89 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  35.54 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.04 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  46.02 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3763  YCII-related protein  38.89 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  37.07 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  41.96 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  35.59 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.21 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  38.14 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  34.51 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  38.94 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  54.05 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  41.96 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  39.82 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  40.52 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  50 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  35.8 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  35.96 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  36.52 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  41.38 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  30.91 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  34.09 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  33.93 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  33.91 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  33.9 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  30.97 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  39.78 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  35.63 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  38.14 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  40.35 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  32.76 
 
 		 120 aa  57  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  49.32 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  32.48 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  44.3 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  37.93 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  34.07 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  35.04 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  36.71 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  34.83 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  35.06 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  34.18 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  36.17 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  38.26 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  35.87 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  30.85 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  30.85 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  30.85 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  41.46 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  31.82 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  38.75 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  32.14 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>