253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8414 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  100 
 
 		 144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  71.09 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  70.25 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  67.19 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  64.06 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  64.84 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  64.84 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  59.23 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  59.23 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  59.23 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  57.43 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  58.59 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  60.66 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  60 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  57.81 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  59.23 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  60 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  60 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  60 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  60 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  60 
 
 		 246 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  60 
 
 		 243 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  57.03 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  59.23 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  57.03 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  57.03 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  53.44 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  55.38 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  56.69 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  56.69 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  54.84 
 
 		 284 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  55.74 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  50.77 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  52.34 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  46.56 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  50.41 
 
 		 279 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  49.24 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  49.24 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  49.59 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  41.22 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  40.91 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  46.34 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  41.13 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  44.72 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  43.9 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  43.9 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  44.72 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  44.72 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  44.72 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  43.9 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  44.72 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  43.9 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  46.46 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  45.53 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  43.9 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  44.72 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  43.09 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  43.9 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  42.74 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  43.09 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  43.09 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  43.09 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  42.75 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  43.44 
 
 		 261 aa  100  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  39.58 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  41.41 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  45.53 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  42.28 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  45.38 
 
 		 391 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  38.73 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  40.31 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  42.2 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  37.4 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  39.52 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.84 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  40.52 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  36.84 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  33.87 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  36.13 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  42.31 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  44.16 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  32.76 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  35.19 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  34.96 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  39.29 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  40.24 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  31.36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  47.73 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  34.78 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  35.96 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  39.08 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  33.06 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  38.95 
 
 		 389 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  33.96 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  40.26 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>