167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5356 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  100 
 
 		 113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  63.64 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  50.45 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  48.62 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  58.06 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  42.24 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  42.61 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  40.52 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  41.82 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  32.17 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  35.09 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  35.25 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  33.94 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  32.65 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  28.7 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  54.17 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  40.3 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  28.32 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  32.74 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  31.62 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  52.08 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  37.31 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  52.08 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  52.08 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  37.68 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  35.79 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  31.07 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  44.23 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  28.7 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  52.08 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  43.64 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  37.14 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  35.64 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  28.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  29.66 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  40.3 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  47.83 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  33.93 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  33.67 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  28.12 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  28.12 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  38.04 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  36.23 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  28.95 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  31.53 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  40 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  36.62 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  46.03 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  36.62 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  29.82 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  46.03 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  29.82 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  36.62 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  44 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  30.51 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  46 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  46.94 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.376227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  28.32 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  27.59 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  27.83 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  44.68 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  43.14 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  42.31 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  34 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  34.33 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  29.13 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  30 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  33.02 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  30.1 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  43.14 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  34.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  28.97 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  33.05 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  42.86 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  35.82 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35.06 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  28.21 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  47.06 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  27.83 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  36.51 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  40 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  48.98 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  41.3 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  39.22 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  30.17 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>