18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1350 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  228  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  41.51 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  42 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  38.24 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  36.56 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  34.69 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  33.66 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  34.38 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  32.65 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  29.79 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  30 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  31.07 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  28 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  27.37 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  29.69 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  28.21 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  33.85 
 
 		 122 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>