194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3338 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  56.07 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  45.79 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  36.61 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  38.18 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  41.82 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  38.74 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  41.96 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  38.89 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  42.71 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  34.51 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  42.16 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  39.36 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  42.16 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  42.16 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  31.25 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  34.82 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  33.64 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  37.37 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  40.68 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  51.02 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  48.28 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  29.46 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  48.28 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  50 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  48.15 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  42.03 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  41.27 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  48.15 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  48.15 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  34.88 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  48.15 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  34.88 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  37.97 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  32.77 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  41.94 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  44.12 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  41.94 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  48.28 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  38.37 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  31.31 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  40.62 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  40.48 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  36.62 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  41.94 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  43.37 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  36.9 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  31.3 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  40.54 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  44.9 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  46.94 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  40.28 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  40.28 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  46.94 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  28 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  35 
 
 		 260 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  42.17 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  45.45 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  32.29 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  47.92 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  37.65 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  45.83 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  38.2 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  45.1 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  48.98 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  30.36 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  35.25 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  37.84 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  47.17 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  30.91 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  51.72 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  30.09 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  51.06 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  31 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  38.89 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  50 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  47.92 
 
 		 389 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  37.33 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  38.38 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  44.9 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  41.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  37.88 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  38.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  47.92 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  34.94 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  30.36 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  31.9 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>