147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0567 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  73.45 
 
 		 114 aa  174  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  72.57 
 
 		 114 aa  169  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  45.95 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  49.56 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  42.61 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  36.94 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  38.18 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  34.38 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  35.16 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  36.84 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34.91 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  31.5 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.29 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  42.47 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  38.24 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  33.62 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  43.66 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  35 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  32.35 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  29.09 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  27.59 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  29.09 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  35.37 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  40.54 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  29.09 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  31.19 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  31.46 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  40.38 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  30.63 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  36.07 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  37.88 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.376227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  38.03 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  30.39 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  27.68 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  32.26 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  35.8 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  33.9 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  42.37 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  34.91 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  35.63 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  26.79 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  44.9 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  47.92 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  48 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  48 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  28.7 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  48 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  47.92 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  41.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  41.51 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  32.46 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  37.7 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  35.82 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  31.65 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  27.73 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  32 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  34.18 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  32.65 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  34.07 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  42.31 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  47.37 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  35.37 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  30.59 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  30.95 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  32.47 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  33.94 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  41.27 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  42.86 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  44.9 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  35.44 
 
 		 117 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 260 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  44.9 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 135 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  35 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>