231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0283 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  64.55 
 
 
108 aa  135  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  55.96 
 
 
105 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  42.15 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  42.28 
 
 
141 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  41.88 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  39.84 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  39.84 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  39.17 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  39.84 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  39.17 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  39.02 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  39.02 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  39.02 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  39.02 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  40.65 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  40.32 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  39.84 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  43.3 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  43.3 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  43.3 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  43.3 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  43.3 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  41.32 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  40.68 
 
 
141 aa  76.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  42.02 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  41.35 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  40.38 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  36.59 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  35.83 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  43.88 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  34.55 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  41.53 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  40.68 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  39.66 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  44.79 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  44.79 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  51.28 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  39.67 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  35.29 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  45.45 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  39.5 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  38.98 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  38.98 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  37.5 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  33.88 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  37.37 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  38.78 
 
 
138 aa  66.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  36.97 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  38.1 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  35.58 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  40.21 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  39.29 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  36.46 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  40 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  35.71 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  42.55 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  35.71 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  38.78 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  36.44 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  37.5 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  40 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  42.55 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  36.17 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  36.17 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  40.43 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  40.21 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  33.67 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  35.04 
 
 
115 aa  59.3  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3785  DGPFAETKE family protein  33.98 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  43.84 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  40.62 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  45.95 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  45.95 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  45.95 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  43.42 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  36.17 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  44.59 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  40.43 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  42.67 
 
 
389 aa  57.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  33.05 
 
 
279 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  34.95 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  33.33 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  38.46 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  33.33 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  31.25 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  30.21 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  34.41 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>