192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4225 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  64.49 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  55.96 
 
 
116 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  44.35 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  43.97 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  41.74 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  42.57 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  39.13 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  39.13 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  39.13 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  39.13 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  40.87 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  41.12 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  40.87 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  40.87 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  40.87 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  40.87 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  41.96 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  41.07 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  43.14 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  39.47 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  44.12 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  38.94 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  40.35 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  40.38 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  40.38 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  38.94 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  39.42 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  41.58 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  41.58 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  41.67 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  40.62 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  39.6 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  37.29 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  41.38 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  38.05 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  40.59 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  43.18 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  40.62 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  33.33 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  43.68 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  42.31 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  44.29 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  38.78 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  44.83 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  34.51 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  39.53 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  39.53 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  39.53 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 
117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  42.53 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  42.53 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  38.37 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  39.08 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  40.79 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  42.86 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  42.11 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  39.24 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  42.86 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  36.84 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  44.29 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  44.29 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  44.29 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  37.97 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  44.74 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  46.48 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  37.76 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  34.88 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  33.33 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
246 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35.63 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  41.43 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  40.79 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  33.67 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  37.76 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  35.53 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
243 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  36.78 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  34.21 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  37.14 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.18 
 
 
389 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  34.94 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  35.71 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  34.94 
 
 
120 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>