209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5743 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  40.87 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  40.87 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  40.87 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 261 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  39.66 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  36.52 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  38.79 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  38.79 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  36.52 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  38.26 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  39.81 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  38.83 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  37.29 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  35.65 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  38.83 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  48.72 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  36.21 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  33.62 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  31.3 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  34.55 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  38.79 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  38.78 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  34.48 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  35.96 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  35.04 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  35.85 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  32.76 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.76 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  34.74 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  41.38 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  37.74 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  41.03 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  38.38 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  38.38 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  41.25 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  38.1 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  31.9 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  37.37 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  35.24 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  41.03 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  37.89 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  33.02 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  35.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  31.62 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  29.82 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  34.34 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  31.9 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.93 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  39.53 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  33.04 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  33.62 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  36.17 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  32.65 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  34.69 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  33.93 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  34.04 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  30.21 
 
 		 251 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  36.14 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  34.26 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3785  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  34.34 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.04 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.04 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  32.71 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2116  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  36.71 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  31.31 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  36.71 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  32.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  30.4 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  33.7 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  30.09 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  34.34 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  33.7 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  33.7 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  31 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  33.7 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>