205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2452 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  65.47 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  65.47 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  66.42 
 
 		 140 aa  196  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  67.88 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  65.47 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  70.31 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  65 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  61.15 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  63.04 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  66.41 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  63.04 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  63.04 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  63.04 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  63.04 
 
 		 246 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  63.04 
 
 		 243 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  62.32 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  58.7 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  57.55 
 
 		 144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  60.87 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  57.97 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  60.14 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  56.12 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  55.8 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  56.83 
 
 		 279 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  66.12 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  60.48 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  60.48 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  54.01 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  54.29 
 
 		 284 aa  157  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  52.52 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  57.03 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  52.24 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  52.99 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  50 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  49.28 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  49.64 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  51.08 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  49.63 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  48.89 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  45.31 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  43.07 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  45.19 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  48.89 
 
 		 391 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  49.17 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  42.45 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  47.5 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  46.77 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  45.74 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  50.42 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  45.45 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  43.33 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  43.33 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  43.33 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  45.45 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  45.45 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  46.83 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  42.5 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  44.63 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  44.63 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  44.63 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  44.63 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  44.17 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  41.13 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  45 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  44 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  40.74 
 
 		 261 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  41.04 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  43.51 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  41.48 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  42.37 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  49.04 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  43.43 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  38.1 
 
 		 251 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  40.6 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  37.5 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  38.28 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  41.28 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  40.21 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.82 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  36.89 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35.83 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  43.88 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  43.88 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  43.88 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  39.18 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  35.92 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.04 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  36.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  36.73 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  35.79 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  34.78 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>