263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5826 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  82.73 
 
 
154 aa  251  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  73.91 
 
 
139 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  71.01 
 
 
139 aa  203  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  73.19 
 
 
138 aa  200  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  64.49 
 
 
139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  60 
 
 
135 aa  173  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  56.3 
 
 
168 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  56.3 
 
 
168 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  56.3 
 
 
168 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  48.91 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  44.36 
 
 
142 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  45 
 
 
141 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  46.61 
 
 
138 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  42.5 
 
 
138 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  51.04 
 
 
136 aa  103  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  44.26 
 
 
141 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  40.15 
 
 
140 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  43.44 
 
 
141 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  38.1 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  44.44 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  40.15 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  42.61 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  39.71 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  40.18 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  37.7 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  43.59 
 
 
138 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  46.46 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  48.35 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  38.98 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
246 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  45.45 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  45.45 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
243 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  45.45 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  46.46 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  39.52 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  40.34 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  41.18 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  40 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  39.83 
 
 
145 aa  90.1  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  37.86 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  43.01 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  40.68 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  37.96 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  37.9 
 
 
147 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  43.36 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  38.64 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  34.43 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  40.17 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  37.9 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  43.43 
 
 
139 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  37.59 
 
 
146 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  43.43 
 
 
139 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  40.83 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  38.02 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  38.66 
 
 
279 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  37.19 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  37.7 
 
 
143 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  38.79 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  34.43 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  37.72 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  37.72 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  36.09 
 
 
391 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  34.71 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  43.9 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  37.93 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  33.06 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  33.88 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  33.88 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  33.88 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  33.88 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  33.88 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  33.88 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  33.88 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  37.37 
 
 
284 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  34.48 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.34 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  33.63 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  36.28 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  36.28 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  38.61 
 
 
261 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  36.7 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  34.71 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  38.74 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>