194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1584 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  72.66 
 
 
141 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  73.53 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  64.34 
 
 
145 aa  200  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  65.03 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  72.8 
 
 
141 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  63.38 
 
 
143 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  63.38 
 
 
143 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  72.8 
 
 
141 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  64.49 
 
 
143 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  62.68 
 
 
143 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  63.83 
 
 
143 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  63.77 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  59.15 
 
 
144 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  65.96 
 
 
142 aa  183  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  63.83 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  59.57 
 
 
140 aa  178  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  60.14 
 
 
145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
145 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
145 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
246 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
145 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
243 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
145 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  59.42 
 
 
145 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  57.45 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  55.63 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  55.94 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  54.61 
 
 
140 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  51.03 
 
 
146 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  52.52 
 
 
139 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  52.52 
 
 
139 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  58.11 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  55 
 
 
140 aa  150  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  62.1 
 
 
147 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  61.9 
 
 
143 aa  150  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  61.24 
 
 
147 aa  147  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  50.72 
 
 
139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  55.73 
 
 
149 aa  144  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  50 
 
 
284 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  57.36 
 
 
137 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  51.05 
 
 
145 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  51.82 
 
 
391 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  48.25 
 
 
279 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  54.55 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  54.1 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  55.74 
 
 
137 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  55.74 
 
 
137 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  45.07 
 
 
145 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  55.74 
 
 
137 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  55.37 
 
 
137 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  54.92 
 
 
137 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  54.92 
 
 
137 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  54.92 
 
 
137 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  54.92 
 
 
137 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  46.26 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  45.65 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  49.59 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  52.8 
 
 
145 aa  127  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  49.6 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  48.18 
 
 
140 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  46.56 
 
 
144 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  46.72 
 
 
140 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  46.72 
 
 
139 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  46.72 
 
 
139 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  46.72 
 
 
139 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  46.72 
 
 
139 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  45.26 
 
 
140 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  47.93 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  46.56 
 
 
139 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  48.36 
 
 
138 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  45.9 
 
 
136 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  45.38 
 
 
261 aa  106  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  47.54 
 
 
136 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  45.38 
 
 
138 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  45.45 
 
 
139 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  45.9 
 
 
139 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  46.77 
 
 
138 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  45.32 
 
 
140 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  44.63 
 
 
138 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  42.98 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  46.08 
 
 
135 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  37.96 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  38.69 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  39.84 
 
 
251 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  46.46 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  46.46 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  46.46 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  39.67 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  42.02 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  32.23 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  34.71 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  40.35 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  34.78 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  31.09 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  40.35 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  35.04 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 
389 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>