219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4099 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  69.92 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  66.42 
 
 		 137 aa  200  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  63.5 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  66.92 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  66.92 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  66.17 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  66.17 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  66.17 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  66.17 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  66.17 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  63.91 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  62.32 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  61.48 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  62.5 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  59.4 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  59.85 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  59.09 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  62.41 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  58.7 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  58.7 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  58.7 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  49.18 
 
 		 147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  49.18 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  47.54 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  45.53 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  48.33 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  48.33 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  49.17 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  47.5 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  50 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  49.17 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  47.5 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  47.93 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  46.67 
 
 		 284 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  50.41 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  47.5 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  44.76 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  48.33 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  45.83 
 
 		 279 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  46.67 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 246 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  47.5 
 
 		 243 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  45.83 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  46.67 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  39.58 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  42.5 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  42.5 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  42.62 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  40 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  42.15 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  38.21 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  41.8 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  42.28 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.34 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  40.65 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  39.67 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  42.98 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  40.32 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  37.4 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  39.84 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  38.1 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  38.33 
 
 		 391 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  37.7 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  40.4 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  36.07 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  35.77 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  33.06 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  38.84 
 
 		 251 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  40.32 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  31.71 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  38.26 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  31.3 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  34.88 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  34.65 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  32.56 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  37.39 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  32.56 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  40.51 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  40.51 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  32.14 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  40.51 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  32.67 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>