237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3488 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  100 
 
 
145 aa  295  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  82.52 
 
 
145 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  80.71 
 
 
143 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  80 
 
 
143 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  78.57 
 
 
143 aa  230  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  73.57 
 
 
143 aa  226  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  73.43 
 
 
144 aa  225  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  74.64 
 
 
143 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  74.64 
 
 
143 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  76.09 
 
 
145 aa  221  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
145 aa  216  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
145 aa  215  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
145 aa  215  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
145 aa  215  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
145 aa  215  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  73.19 
 
 
141 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
243 aa  214  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  71.43 
 
 
246 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  79.03 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  72.54 
 
 
140 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  78.23 
 
 
141 aa  207  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  75.37 
 
 
140 aa  206  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  70.37 
 
 
143 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  68.15 
 
 
141 aa  203  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  72.06 
 
 
138 aa  201  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  64.34 
 
 
143 aa  200  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  67.38 
 
 
142 aa  191  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  68.18 
 
 
140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  64.23 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  61.97 
 
 
141 aa  173  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  60.69 
 
 
284 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  56.94 
 
 
279 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  69.42 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  55.8 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  55.8 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  52.41 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  59.29 
 
 
140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  57.25 
 
 
137 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  58.52 
 
 
391 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  60 
 
 
144 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  60.94 
 
 
147 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  54.79 
 
 
147 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  60.94 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  62.5 
 
 
147 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  51.49 
 
 
145 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  60 
 
 
137 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  60.33 
 
 
137 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  60.33 
 
 
137 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  60.33 
 
 
137 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  56.2 
 
 
137 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  59.5 
 
 
137 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  59.5 
 
 
137 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  59.5 
 
 
137 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  59.5 
 
 
137 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  55.38 
 
 
149 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  46.43 
 
 
146 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  56.35 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  48.91 
 
 
139 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  53.23 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  49.63 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  51.67 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  53.33 
 
 
139 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  51.67 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  51.67 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  51.67 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  53.33 
 
 
137 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 
140 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  50 
 
 
137 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  49.17 
 
 
136 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  43.44 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  47.01 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  48.31 
 
 
261 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  45.24 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  43.59 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  41.6 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  45 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  39.71 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  40.83 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  49 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  41.61 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  40.17 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  42.06 
 
 
251 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  41.18 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  36.03 
 
 
142 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  40.83 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  39.17 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  41.24 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  41.24 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  41.24 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  40.98 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.9 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  32.11 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  38.14 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 
389 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  30.97 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  46.15 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>