258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3518 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  83.82 
 
 		 136 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  78.95 
 
 		 138 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  74.29 
 
 		 139 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  76.74 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  66.67 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  68.89 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  70.15 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  53.17 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  50 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  50 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  49.21 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  44.63 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  46.61 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  45 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  45 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  43.9 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  41.18 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  46.03 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  45.45 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  46.03 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  42.45 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  45.38 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  44.54 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  45.24 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  44.17 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  45.08 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  40.8 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  42.5 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  41.8 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  43.52 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  40.83 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  40.83 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  42.28 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  42.86 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  43.44 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 246 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 243 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  35.51 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  37.59 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  42.48 
 
 		 389 aa  93.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  39.29 
 
 		 391 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  37.7 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  37.7 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  37.7 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  37.06 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.98 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  39.53 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  41.46 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  45 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  36.88 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  39.53 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  39.53 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  39.53 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  39.53 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  39.17 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  37.29 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  37.8 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  39.17 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  36.07 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  34.82 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  40.6 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  40.6 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  42.7 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  34.21 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  40.16 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  36.07 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  38.02 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.07 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  38.61 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  37.6 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  36.44 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  38.21 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  38.98 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  39.34 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  41.41 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  36.75 
 
 		 279 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  34.43 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  41.76 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>