262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6888 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  76.74 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  72.46 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  72.26 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  75.19 
 
 		 136 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  64.39 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  64.34 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  61.65 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  52.34 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  51.56 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  51.56 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  50.78 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  50 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  53 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  49.59 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  49.59 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  43.31 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  45.31 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  44.53 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  46.77 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  45.45 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  48.04 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 246 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  50 
 
 		 243 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  49.5 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  50.52 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  44.88 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  48.51 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  48.51 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  51 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  47.37 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  49.49 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  49 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  48.51 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  48.45 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  45.97 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  41.48 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  45.97 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  51.14 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  48.48 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  45.97 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  40.65 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  45.6 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  49 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  43.09 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  50 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  45.16 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  42.19 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  43.2 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  48.35 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  41.5 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  43.64 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  43.64 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  43.64 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  40.82 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  40.82 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  40.82 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  47.47 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  43.2 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  49.04 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  49.04 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  46.94 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  41.35 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  40.82 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  37.5 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  40.97 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  46.32 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  40 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  42.48 
 
 		 389 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.5 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  42.16 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  46 
 
 		 279 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  39.29 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  42.57 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  39.29 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  41.13 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  41.94 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  38.33 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  36.44 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  36.44 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  40.4 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  46.43 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  39.67 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>