269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3712 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  98.29 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  94.87 
 
 		 117 aa  224  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  92.31 
 
 		 117 aa  218  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  92.31 
 
 		 117 aa  218  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  92.31 
 
 		 117 aa  218  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  90.6 
 
 		 117 aa  217  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  68.1 
 
 		 117 aa  166  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  67.24 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  67.24 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  67.24 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  67.24 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  67.24 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  67.24 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  67.24 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  66.38 
 
 		 142 aa  159  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  63.79 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  64.1 
 
 		 117 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  63.25 
 
 		 389 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  58.62 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  62.07 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0022  hypothetical protein  65.52 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  44.64 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  40.35 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  39.47 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  40.18 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  40.18 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  40.18 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  39.29 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  49.37 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  36.28 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  40.18 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  38.74 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  36.84 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  36.61 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.72 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  39.09 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  37.72 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.65 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  41.98 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  43.02 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  42.35 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.93 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  34.82 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  34.82 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  40.7 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  40.7 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  43.02 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  37.93 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  30.36 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  37.29 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  43.04 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  38.33 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  35 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  30.43 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  37.25 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  35 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  34 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  35 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  40.96 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  36.19 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  35.24 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  33.91 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  36.13 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  35.09 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  35.24 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  35.24 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  41.03 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  35.24 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  36.63 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  39.73 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  38.14 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  39.8 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  33.06 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  39.77 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.36 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  41.96 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>