265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4396 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  229  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  60.34 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  45.69 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  48.25 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  56.63 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  42.98 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  43.86 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  46.9 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.47 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  44.92 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  45.69 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  42.73 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  43.7 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  42.5 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  41.82 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  40.5 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  41.03 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  41.38 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  44.57 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  39.5 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  40.52 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  40.68 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  41.74 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  41.9 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  37.6 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  39.52 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  38.98 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  48.74 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  40.71 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  44.57 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  51.19 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  51.19 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  51.19 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  43.24 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  37.19 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  37.7 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  38.02 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  32.48 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  36.59 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  31.4 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  49.41 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  42.11 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  34.78 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  36.89 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  31.71 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  38.04 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  46.34 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.48 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.5 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  48.72 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  38.04 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  40.98 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  39.08 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  32.67 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  31.78 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  35.29 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  34.86 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  41.07 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  38.04 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  32.71 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  46.99 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  41.89 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  30.33 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  39.29 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  31.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.26 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  39.83 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  31.09 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  29.66 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  40.48 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  41.49 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  30.51 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  38.74 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  30.84 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  37.39 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  36.28 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  35.16 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  33.88 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  30.58 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  30.58 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  37.04 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  29.66 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  42.86 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  30.89 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  30.51 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  30.51 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.04 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  36.26 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  30.51 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  30.51 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>