233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4175 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  60.83 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  60.83 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  38.84 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  40.83 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  42.74 
 
 		 226 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  41.32 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  39.32 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  37.61 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  39 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  35.83 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  36.13 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  38.79 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  37 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  40.2 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  32.48 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.33 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  31.67 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  31.93 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  38.83 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  43.02 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.62 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  38.14 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  30 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  32.35 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  44.19 
 
 		 389 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  35.35 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  37.19 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  34.45 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  36.13 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  38.55 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  29.91 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  35 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  31.93 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  34.45 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  32.48 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  35.29 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  35.54 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  37.25 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  36.54 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  36.05 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.58 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  33.61 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  35 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  34.17 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  33.61 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  31 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  33.61 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  33.61 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  30.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  29.91 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0022  hypothetical protein  51.72 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  35.54 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  33.33 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  30 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  33 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  29 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  34.38 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  34.41 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  35.58 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.25 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  32.82 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  33.98 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  27.62 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  29.06 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  38.16 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  40.58 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  34.19 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  32.38 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  35.43 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  30.83 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  33.01 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  31.01 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  35.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>