213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6898 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  76.86 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  74.79 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  73.55 
 
 		 123 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  73.73 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  71.07 
 
 		 123 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  73.73 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  63.93 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  63.11 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  62.81 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  61.67 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  57.63 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  56.3 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  62.5 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  48.36 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  37.29 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.67 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  40.34 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  40.71 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  38.14 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  38.14 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  39.66 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  38.14 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  39.5 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  36.13 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  37.39 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  35.45 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  37.17 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  38.05 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  37.19 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  37.5 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  38.14 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  34.17 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  36.94 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  36.52 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  37.37 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  32.76 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.07 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  37.61 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  47.14 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  30.17 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  37.65 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  49.3 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  33.33 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  32.17 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  30.7 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  30.7 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  35.19 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  36.19 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  34.51 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  30.17 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  35.19 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.09 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  35.19 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  35.19 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  35.19 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  46.15 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  30.77 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.03 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  36.05 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  30.89 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  48.15 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  47.27 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  36.46 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  36.46 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  32 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  33.33 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  43.66 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  31.78 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  33.66 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  32.67 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  32.48 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  39.13 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  31.62 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  32.99 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  31.58 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  38.82 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  45.31 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  43.94 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  31.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  33.04 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  31.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  31.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  39.02 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  36.26 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  44.9 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  29.29 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  38.82 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>