131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0137 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  88.62 
 
 		 123 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  60.83 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  37.14 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  39.05 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  37.61 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  34.19 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  39 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  31.09 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  31.09 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  37 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  33.33 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  29.06 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  31.4 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  32.69 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  31.62 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.27 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  30.39 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  32.48 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  30.48 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  32.38 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  27.35 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  34.31 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  38.24 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  31.62 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  28 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  29.52 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  29.52 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  39.71 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  27.88 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  25 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  30.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  39.71 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  31.43 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  36.23 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  32.5 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  26.89 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  40.91 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  31.73 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  38.16 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  30 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  33.94 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  27.62 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  29 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  41.18 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  30.39 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  33.33 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  42.65 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  30.84 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  34.15 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  29.91 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  23.81 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  25.71 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  28.69 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  32.43 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  36.49 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  31.65 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.14 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  27.37 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  46 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  44 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  26.17 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  32.14 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  42 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  38 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  30.69 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  28 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  50 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  39.68 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  32.53 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  31.76 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>