263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2256 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  65.45 
 
 
113 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  54.46 
 
 
110 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  46.15 
 
 
118 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  41.96 
 
 
128 aa  103  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  47.27 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  43.48 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  40 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  41.59 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  41.23 
 
 
114 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  45.3 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  41.59 
 
 
114 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 
115 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40.71 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  52.63 
 
 
119 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  39.82 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  39.82 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  42.61 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  40.5 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  45.54 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  40.83 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  43.75 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  38.37 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  38.26 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  57.38 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  44.71 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  50 
 
 
226 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  34.82 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  55.93 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  43.24 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  48.28 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  44.3 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  39.32 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  38.71 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  41.41 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  39.52 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  39.17 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  38.71 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  39.29 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  38.33 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  41.12 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  38.05 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  45.95 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  40.58 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  37.9 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  40 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  40.52 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.67 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  38.98 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  38.66 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  35.83 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  38.66 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  38.66 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  34.69 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  36.67 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  34.69 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  32.46 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  34.19 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.63 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  33.67 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  37.82 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  38.16 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  37.39 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  37.82 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  34.51 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  37.82 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  37.82 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  37.04 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  37.82 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  38.71 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  37.29 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  38 
 
 
118 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  32.43 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  43 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  33.33 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  35.04 
 
 
116 aa  59.3  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  32.17 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  35.16 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>