215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3354 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  37.61 
 
 
122 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  51.43 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  43.48 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  47.44 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  41.96 
 
 
124 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  44.09 
 
 
117 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  51.47 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  47.14 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  30.51 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  50 
 
 
114 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.83 
 
 
119 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  41.11 
 
 
116 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  50.72 
 
 
114 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  49.28 
 
 
114 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  40 
 
 
122 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  45.71 
 
 
116 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 
118 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  49.28 
 
 
114 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  36.21 
 
 
114 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  43.06 
 
 
114 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  40.82 
 
 
115 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  38.89 
 
 
119 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  38.75 
 
 
117 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  38.75 
 
 
117 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  53.73 
 
 
118 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  41.18 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  35.4 
 
 
117 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  39.09 
 
 
135 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 
118 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  32.58 
 
 
389 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  33.01 
 
 
119 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  45 
 
 
120 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.78 
 
 
118 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  44.44 
 
 
119 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  43.02 
 
 
113 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  44.12 
 
 
110 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  46.38 
 
 
112 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.25 
 
 
117 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  47.06 
 
 
120 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  44.78 
 
 
118 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34.34 
 
 
146 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  31.97 
 
 
136 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  40.58 
 
 
139 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  37.38 
 
 
122 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  37.38 
 
 
122 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  37.66 
 
 
117 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  44.12 
 
 
120 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  34.29 
 
 
123 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  39.13 
 
 
118 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  34.95 
 
 
112 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  36.56 
 
 
118 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  29.27 
 
 
123 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  32.23 
 
 
122 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  34.26 
 
 
117 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  41.54 
 
 
136 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  34.26 
 
 
117 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  34.26 
 
 
117 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  42.25 
 
 
120 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  34.74 
 
 
138 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  44.07 
 
 
126 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  42.86 
 
 
128 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  30.56 
 
 
119 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  39.73 
 
 
115 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  37.11 
 
 
117 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  39.74 
 
 
122 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  32.41 
 
 
119 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  36.25 
 
 
117 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  39.77 
 
 
122 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  41.77 
 
 
118 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  45.59 
 
 
123 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  36.75 
 
 
125 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  33.98 
 
 
112 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  38.16 
 
 
126 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  44.16 
 
 
116 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  32.74 
 
 
117 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  35.09 
 
 
118 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  40.74 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  39.42 
 
 
115 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  28.81 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  32.48 
 
 
120 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  32.74 
 
 
117 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  32.74 
 
 
117 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  32.74 
 
 
117 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  42.65 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  35.58 
 
 
116 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  32.61 
 
 
137 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  53.19 
 
 
120 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 
124 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  34.95 
 
 
116 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  35.14 
 
 
124 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  30.26 
 
 
120 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  36 
 
 
126 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  45.45 
 
 
128 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  36 
 
 
126 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  36 
 
 
126 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  35.14 
 
 
124 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>