230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0813 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  75.83 
 
 		 120 aa  192  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  58.12 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  53.28 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  50.88 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  58.12 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  62.2 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  44.44 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  42.74 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  43.1 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  40.91 
 
 		 233 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  38.14 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  41.23 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  37.1 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  43.33 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  40.45 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  40.71 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  36.21 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  37.63 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  44.3 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  40 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  35.34 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  33.04 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  38.75 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  42.35 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  35.4 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  39.76 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  39.24 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  41.3 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  40.24 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.56 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  38.82 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  38.27 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 389 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  36.19 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40.45 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  35.65 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  43.75 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.39 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  41.33 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  38.89 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  35.87 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  34.69 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  40.96 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  34.69 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  36 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  32.26 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  30.17 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  31.03 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  39.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  34.69 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  39.24 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  39.24 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  50.72 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  39.24 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  34.51 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  34.21 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  35.42 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  32.76 
 
 		 114 aa  57  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  38.78 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  36.71 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  33.33 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  43.66 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  38.16 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  34.55 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  36.43 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  36.43 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  58.33 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  30.97 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  37.08 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  29.89 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  38.39 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  47.06 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  41.11 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  43.21 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  37.08 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  30.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  36.84 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  36.17 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  34.88 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  32.91 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  31.46 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>