203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0074 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  100 
 
 		 107 aa  216  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  58.26 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  54.21 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  62.2 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  48.7 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  46.9 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  39.66 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  43.53 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  38.26 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  37.04 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  34.55 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  41.89 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  42.7 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  35.78 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  32.52 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  37.84 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  39.76 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  39.76 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  40.7 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  36.14 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  36.13 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  36.9 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  30.19 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  34.23 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  31.86 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  36.05 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  39.13 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  32.46 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.8 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  32.69 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  35.4 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  33.73 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  32.63 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  33.73 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  33.73 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  31.25 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  41.27 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  31.33 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  34.57 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  32.73 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  28.97 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  30.7 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  31.53 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  32.74 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  32.97 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  40.32 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  36.78 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  34.38 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  32.93 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  43.53 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  32.41 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  31.82 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.49 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  33.94 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  34.07 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  34.34 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  32.11 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  29.2 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  34.94 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  31.91 
 
 		 284 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  37.8 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  37.8 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  39.13 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  35.16 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  38.55 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  30.59 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  29.2 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  39.08 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  34.52 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  31.48 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  32.26 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  29.63 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  31.71 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  29.73 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  31.43 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  29.73 
 
 		 389 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  33.82 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>