225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3072 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  100 
 
 
117 aa  244  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  42.17 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  39.64 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  41.96 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  37.84 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  36.54 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  34.57 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  42.35 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  37.38 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  41.67 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  35.65 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  36.36 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  42.5 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  33.01 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  36.59 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  33.33 
 
 
233 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  42.17 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  51.85 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  34.52 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  37.62 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  37.04 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  32.74 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  34.04 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.71 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  45.1 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  43.33 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  40 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.78 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  45.45 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  31.78 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  33.66 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  32.29 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  52 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  31.25 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  37.5 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  33.72 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  34.31 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34.85 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  35.44 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  32.99 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  39.29 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  46.81 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  32.14 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  33.02 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35.8 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  48.89 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  37.21 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  35.71 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  34.17 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  36.36 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  32.26 
 
 
138 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  37.97 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  32.53 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  32.67 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  38.27 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  43.33 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  35.48 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  39.62 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  40.32 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.53 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  41.67 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  31.78 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  35.35 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  35.35 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  32.97 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  36.07 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  28.69 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  36.07 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  39.62 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  48.94 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  33.98 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  32.53 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  43.33 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  34.85 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  45 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  45.31 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  30.12 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  35.35 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  41.67 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  35.35 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  35.35 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  30.84 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  44.64 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  48.15 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  44.29 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  42.67 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  43.14 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>