208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4763 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  100 
 
 
131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  57.25 
 
 
132 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  47.01 
 
 
133 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  43.18 
 
 
135 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  45.11 
 
 
135 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  45.45 
 
 
135 aa  105  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  45.74 
 
 
135 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  43.18 
 
 
135 aa  103  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  46.92 
 
 
135 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  46.92 
 
 
135 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  46.15 
 
 
135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  42.11 
 
 
146 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  42.75 
 
 
136 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  42.31 
 
 
132 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  43.18 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  42.75 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  39.69 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  40.15 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  40.31 
 
 
160 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  41.12 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  36.8 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  39.23 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  37.5 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  34.92 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  41.44 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  36.89 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  36.29 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  34.35 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  35.83 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  35.83 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  35.83 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  36.07 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  35.16 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35.16 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  40 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  39.22 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.2 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  38 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  42.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  34.91 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34.15 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  33.06 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.71 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  37.96 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  36.19 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  33.01 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.01 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  35.82 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  31.78 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.79 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  33.87 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  33.66 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  38.71 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  33.06 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  37.37 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  37.62 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  34.71 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  38.4 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  35.29 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  33.87 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  38.37 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  33.06 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  34.91 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  33.87 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  31.45 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  36 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  31.54 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  37.04 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  31.01 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  35.71 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  29.46 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  34.69 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  30.33 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  31.31 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  32.69 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  35.85 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  29.52 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  29.52 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  33.01 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  40.58 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  29.52 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  29.52 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  29.52 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  29.52 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  29.52 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  34.34 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  34.69 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  40.58 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  32.33 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  43.48 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  40.58 
 
 
143 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  32.69 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>