208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4325 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 135 aa  276  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  91.85 
 
 		 135 aa  257  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  89.63 
 
 		 135 aa  250  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  79.26 
 
 		 135 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  79.26 
 
 		 135 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  79.26 
 
 		 135 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  82.09 
 
 		 135 aa  226  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  78.2 
 
 		 135 aa  220  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  74.26 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  72.79 
 
 		 136 aa  203  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  73.28 
 
 		 132 aa  199  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  71.85 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  73.44 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  67.41 
 
 		 160 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  61.48 
 
 		 136 aa  173  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  63.2 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  56.39 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  52.63 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  53.12 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  46.92 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  44.7 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  45.45 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  40.88 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  36.36 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  34.38 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  38.89 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  40.78 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  40.43 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  34.11 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  37.29 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  34.13 
 
 		 123 aa  57  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  38.54 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  35.94 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  44.78 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  46.27 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  47.83 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  34.88 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  34.88 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  36.61 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33.93 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  45.71 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  32.95 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  32.5 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  32.33 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  33.59 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  34.31 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  40.96 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  34.78 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  31.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  46.48 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  32.81 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  37.89 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  32.46 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  34.19 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  44.29 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.07 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  36.63 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  32.28 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  42.86 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  32.94 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  36.46 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  37.76 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  33.78 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  33.86 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  35.29 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  30.39 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.65 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  32.41 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  34.26 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  40.91 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  34.83 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  35.05 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  32.61 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  35.48 
 
 		 261 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  37.5 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  32.61 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  39.13 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  36 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  34.74 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  33.78 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>