264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1521 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  100 
 
 		 118 aa  240  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  52.14 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  49.15 
 
 		 389 aa  123  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  48.7 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  47.01 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  50.43 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  49.57 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  51.3 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  50.43 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  50.43 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  50.43 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  47.83 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  49.57 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  47.83 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  47.83 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  46.96 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  46.96 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  46.96 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  46.96 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  46.96 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  46.96 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  46.09 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0022  hypothetical protein  47.86 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  34.82 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  36.79 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  39.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  33.93 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  34.51 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  34.55 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  37.17 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  32.73 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  34.23 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.6 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  41.28 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  31.86 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  42.16 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  42.16 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  42.16 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  36.19 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  39.64 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.63 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  35.4 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  34.65 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  32.48 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  36.84 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  40.2 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  40.2 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  33.93 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  34.65 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  40.2 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  33.04 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.64 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  37.11 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  33.33 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  40.2 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  38.84 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  40.2 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  40.2 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  44.74 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  36 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  44.74 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  38.89 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  36 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.62 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  39.22 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  40.2 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  39.22 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  39.22 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  29.57 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  37.65 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  34.55 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  43.42 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  38 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  38.37 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  33.64 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  46.05 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.91 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  38.79 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  37.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  46.75 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  39.6 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  37.21 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  34.21 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  38.14 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>