270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6406 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  100 
 
 
123 aa  256  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  88.43 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  46.9 
 
 
123 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  45.3 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  48.67 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  47.79 
 
 
118 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  44.74 
 
 
118 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  42.98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  45.95 
 
 
125 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  45.54 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  45.54 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  45.54 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  38.94 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  44.64 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  41.38 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  40.83 
 
 
119 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  43.86 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 
114 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  39.29 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 
115 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  40.54 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  45.98 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  39.29 
 
 
116 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  38.74 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  38.39 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  33.04 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  38.39 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  35.71 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  35.59 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  41.05 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  34.82 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  36.75 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  36.61 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  33.93 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  36.44 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  40.45 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  41.23 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  32.73 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  43.24 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  32.14 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  44.71 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  35.04 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  37.84 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  34.23 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  29.91 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  29.91 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  40.23 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  33.05 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  41.38 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  33.93 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  38.95 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  38.3 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  34.23 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  34.82 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  33.87 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  37.98 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  35.09 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  38.3 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  36.07 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  41.38 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  37.98 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  37.98 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  37.98 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  37.98 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  38.3 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  33.93 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  32.76 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  36.84 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  37.21 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  33.87 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  34.23 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  40.34 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  35.87 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  31.25 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  37.23 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  36.75 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  35.9 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  36.56 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  33.93 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  41 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  39.83 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  40.48 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  40.96 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  36 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  36 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>