263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0409 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  49.12 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  48.25 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  48.25 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  49.12 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  45.61 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  45.22 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  45.22 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  44.35 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  44.44 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  43.48 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  44.35 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  42.11 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  36.94 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  42.34 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  39.09 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  38.18 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  40.54 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  36.21 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.74 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  41.28 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  40.18 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  40.35 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  40.71 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  38.26 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  37.84 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  39.64 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  39.64 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  39.64 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  37.84 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  45.92 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  43.43 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  38.74 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  36.36 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  41.28 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  46.94 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  43.43 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  36.44 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  43.43 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  35.14 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  43.43 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  43.43 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  38.74 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  44.83 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  43.43 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.29 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  37.84 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  38.89 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  37.84 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  37.84 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  37.84 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  37.84 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  37.84 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  37.84 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  35.48 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  41.84 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  46.15 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  43.88 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  37.5 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  43.4 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  33.04 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.61 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  39.76 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  33.63 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  38.26 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  36.04 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  30.77 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  41.38 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  38.26 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  35.14 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  36.04 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  33.63 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  32.43 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  34.12 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  35.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  37.61 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  38.78 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.93 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  36.94 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  37.72 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  36.94 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>