258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5538 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  97.14 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  95.68 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  95.68 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  95.68 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  95.68 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  89.29 
 
 		 140 aa  256  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  76.64 
 
 		 137 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  76.69 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  75.94 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  73.72 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  73.72 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  73.72 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  73.72 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  75.94 
 
 		 137 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  69.12 
 
 		 137 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  66.18 
 
 		 137 aa  196  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  65.69 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  59.85 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  59.4 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  62.32 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  62.96 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  56.35 
 
 		 143 aa  136  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  54.76 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  54.17 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  55.83 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  49.66 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  50.41 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  55 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  50.82 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  50 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  50.82 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  52.85 
 
 		 142 aa  129  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  53.33 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  48.18 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  53.33 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  53.33 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  53.33 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  53.33 
 
 		 246 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  53.33 
 
 		 243 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  52.5 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  53.28 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  52.5 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  52.07 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  46.72 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  45.97 
 
 		 284 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  46.48 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  50.83 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  42.03 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  44.37 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  49.18 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  45.83 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  44.63 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  41.89 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  43.8 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  41.73 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  45.53 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  40.32 
 
 		 279 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  42.5 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  44.72 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  41.09 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  48.33 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  39.72 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  38.69 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  42.4 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  37.06 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  41.13 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  36.88 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  42.57 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  39.17 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  41.35 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  36.67 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  37.72 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  40.52 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  43.3 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  37.39 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  40.87 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  45.36 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  39 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  38.89 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  39.84 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  43.43 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  43.3 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  37.01 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  37.4 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35.92 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  37.19 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  41.18 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  38 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>