254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6623 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  72.17 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  58.93 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  47.75 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  47.71 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  50 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  43.64 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  44.14 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  45.35 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  39.39 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  41.44 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  36.84 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  38.82 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  40.54 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  39.74 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  38.2 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  39.77 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  43.82 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  34.29 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  39.47 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  39.76 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  45.35 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  35.29 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  36.36 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  42.67 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  41 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  44.71 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.5 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  34.95 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  38.71 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  42.03 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  41.33 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  40.54 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  34.74 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  31.96 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  42.53 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  42.53 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.71 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  36.05 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  42.53 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  39.02 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  37.97 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  36.9 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  41.77 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  37.29 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  29.81 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  34.58 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  36.44 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  36.21 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  39.24 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  36.46 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  29.81 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  35.04 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  39.24 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  41.18 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  36.62 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  35.71 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  30.1 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  40 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  32.69 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  36.25 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  36.14 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  34.09 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  36.54 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  34.19 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  33.64 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  37.97 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  33.02 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  37.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  36 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.33 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  30.3 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  31.73 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  28.57 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  35.79 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  34.09 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  32.53 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  32.53 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  32.65 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  34.19 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  30.53 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  32.53 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  32.53 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>