68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5221 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  53.19 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  48.31 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  48.31 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  36.13 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  42.31 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  38.38 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  43.02 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  39.51 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  39.77 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  36.56 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  38.89 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.73 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  39.08 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  31.62 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  32.1 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  35.79 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  28.32 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  31.08 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  27.78 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  30 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  40.35 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  30.12 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  32 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  32.39 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5203  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0516537  normal  0.258786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  34.26 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  32 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  27.36 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  27.36 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  27.36 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  31.08 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  29.49 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  27.27 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  31.08 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  35.9 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  30.26 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  25 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  30.43 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  34.83 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  31.78 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  28.09 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  28 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  38.1 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  27.59 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  38.37 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  34.18 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  28.42 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  26.83 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  35.48 
 
 		 133 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  26.44 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  32.35 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.3 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  31.78 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  37.33 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  32.22 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  32.95 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  32.22 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  31.76 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  30 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  31.03 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  25.33 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  33.87 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>