238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4760 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  50 
 
 
133 aa  119  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  40.16 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  40.16 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  37.8 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  37.14 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  36.89 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  33.07 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  35.77 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  36.3 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.97 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  34.35 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  35.2 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  32.82 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  34.92 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  31.15 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  39.82 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  38.18 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  37.69 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  35.24 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  39.78 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  36.92 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  35.11 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  36.92 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  34.13 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  40 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  33.87 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  39.8 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  33.93 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  42.11 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  37.17 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  40.37 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  35.34 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  31.71 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  33.81 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  31.96 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  32.26 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  35.77 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  32.26 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  32.26 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  31.5 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  30.37 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  29.75 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  33.06 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  31.45 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  35.56 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  42.25 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  31.11 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  31.11 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  34.19 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  27.05 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  34 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  29.92 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  29.6 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  31.45 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  46.38 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  33.94 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  41.43 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  33.04 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  30.88 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  29.51 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  29.51 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  30.65 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  31.11 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  29.63 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  28.69 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  30.37 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  37.8 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  29.63 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  27.05 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  29.51 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  43.08 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  30.4 
 
 
391 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  29.41 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.07 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  34.13 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  33.09 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  37.36 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  28.83 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  39.13 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  28.68 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  32.08 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  33.33 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  30.33 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  32.31 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  29.6 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  33.02 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  29.77 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  29.84 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>