220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4747 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  100 
 
 		 136 aa  276  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  78.2 
 
 		 136 aa  217  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  76.69 
 
 		 136 aa  216  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  74.02 
 
 		 132 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  75 
 
 		 135 aa  196  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  76.19 
 
 		 135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  73.02 
 
 		 135 aa  194  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  73.44 
 
 		 135 aa  191  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  69.53 
 
 		 135 aa  186  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  69.53 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  69.53 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  68.75 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  69.84 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  65.08 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  61.03 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  58.87 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  60.32 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  58.87 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  50.39 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  45.04 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  47.73 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  42.75 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  40.62 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  36.3 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  37.04 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  39.69 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  33.83 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  38.71 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  34.09 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  34.78 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  34.88 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35.11 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  38.17 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  38.83 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.35 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  42.71 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  42.71 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  42.71 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  46.15 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  40.4 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  41.67 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  36.28 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  39.58 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  33.1 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  41.94 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  35.51 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  36.11 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  35.43 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  34.09 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  34.65 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  32.04 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  37.14 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  36.45 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  40.86 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  40.86 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  33.96 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  38.95 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  30.39 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  33.65 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  40.86 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  40.86 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  40.86 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  40.86 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  40.86 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.09 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  35.71 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  32.54 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  30.53 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  40 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  35.37 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  32.12 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  28.04 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  37 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  43.21 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.21 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  33.65 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  37.21 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  36.45 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  38.38 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  35.06 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  36.56 
 
 		 261 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  38.36 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  37.76 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  36.61 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  32.47 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  34.41 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  38.89 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  34.81 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  44.78 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  39.74 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>