218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3965 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  63.56 
 
 
126 aa  157  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  60.83 
 
 
123 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  57.63 
 
 
122 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  57.02 
 
 
123 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  57.14 
 
 
123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  56.3 
 
 
123 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  53.78 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  50 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  50 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  51.26 
 
 
129 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  55.08 
 
 
124 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  53.78 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  38.84 
 
 
128 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  39.47 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.47 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  35.96 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  37.07 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  38.46 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  39.5 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  34.19 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  37.82 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  36.04 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 
226 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  35 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  33.62 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  34.48 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  33.64 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  30.63 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  31.93 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  35 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  52.11 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  35.4 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  30.83 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  46.43 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  36.84 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  38.26 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  34.17 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  43.06 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  30.65 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.9 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  33.33 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  30.36 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  34.51 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  47.06 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  30.17 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  32.2 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  33.61 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  33.94 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  33.94 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  36.19 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  34.78 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  37.14 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  27.68 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  45.1 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  33.62 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  28.32 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  38.04 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  30.7 
 
 
122 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  45.1 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  30.63 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  31.62 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  33.93 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  32.99 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  50 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  31.07 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  35.79 
 
 
260 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  33.68 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  44.29 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  35.09 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  36.05 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  31.62 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  33.61 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  43.14 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  31.19 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>