106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3821 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  82.35 
 
 		 136 aa  234  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  61.07 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  57.94 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  58.87 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  56.39 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  57.69 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  55.22 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  54.48 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  56.59 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  56.59 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  55.81 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  55.64 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  56.35 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  52.31 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  51.91 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  52.71 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  53.38 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  48.84 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  46.97 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  48.39 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  40.15 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  38.97 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  36 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  33.04 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  38.38 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  31.88 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  33.59 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  32.12 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  30.84 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.58 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  40.23 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  29.57 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  36.47 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  31.07 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  35.29 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  36.23 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  29.91 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  35.16 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  37 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  30.58 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.02 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  38.3 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  39.08 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  39.08 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  29.41 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  32.22 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  39.08 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  39.08 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  39.08 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  39.08 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  34.41 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  41.38 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  30.69 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  35.92 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  27.61 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  31.68 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  34.33 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  34.48 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.67 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  29.07 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  29.91 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  31.34 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  31.39 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  32.05 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  29.21 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  31.94 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  32.76 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  37.88 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  26.85 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  30.59 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  25.51 
 
 		 142 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  33.71 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  28.28 
 
 		 389 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  30.09 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  29.21 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  31.31 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  31.4 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  34.07 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  32.22 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  28.36 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  30.19 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  34.04 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>