169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4112 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  46.15 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  47.24 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  40.88 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  42.54 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  42.11 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  43.41 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  43.41 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  42.64 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  44.19 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  41.79 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  42.96 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  43.85 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  44.09 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  43.31 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  43.07 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  40.62 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  39.39 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  41.01 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  38.06 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  41.41 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  38.97 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  39.2 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  48.48 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  38.14 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  38.66 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  36.36 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  38.68 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  40.37 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  37.74 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  35.45 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  44.05 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  50 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  35 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  35.45 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  35.45 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  35.45 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  37.82 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  46.38 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  41.84 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  32.2 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  35.92 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  38.3 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  36.45 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  32.09 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  36.54 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34.65 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  38.61 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  42.05 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  45.21 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  33.65 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  37.14 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  38.1 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  42.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  35.05 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  34.69 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  32.04 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  38.46 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  34.65 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  32.82 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  35.8 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  32.94 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  36.08 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  36.56 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35.34 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  32.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  34.17 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  37.74 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  37.97 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  34.17 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.98 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.4 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  36.27 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  36.78 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  36.89 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  30.84 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  36.14 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  39.47 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  32.67 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  33.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  31.9 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  34.26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  33.68 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  38.1 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  33 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  38.89 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  37.11 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>