162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0528 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  100 
 
 		 114 aa  231  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  85.09 
 
 		 114 aa  204  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  73.45 
 
 		 111 aa  174  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  47.37 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  42.24 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  40.52 
 
 		 113 aa  93.6  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  38.94 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  40.87 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  41.24 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  32.65 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  33.64 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  36.17 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  39.76 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  34.48 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35.51 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  35.71 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  41.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  28.1 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  31.62 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  28.1 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  38.04 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  33.88 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  35.56 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  28.43 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  37.93 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  32.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  30.39 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  27.27 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  32.04 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  33.67 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  39.08 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  29.31 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  38.82 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  27.78 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  29.46 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  31.9 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  38.2 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  38.75 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  38.57 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  32.73 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  33.94 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  29.31 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  29.47 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  29.2 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  28.32 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  29.2 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  40.74 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  34.38 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3017  hypothetical protein  35.56 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.376227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  36.11 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  41.67 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  36.11 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  34.25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  29.06 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  32.82 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  41.51 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  37.1 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  38.18 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  39.44 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  29.06 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  34.72 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  40.38 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  34.85 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  35.59 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  42.59 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  47.73 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  39.62 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  34.29 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  34.94 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  28.32 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  45.1 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  39.62 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  28.21 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  32.91 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.62 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  44 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  37.74 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  44 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  51.22 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  34.38 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>