19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3017 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.376227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0344  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234737  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5111  hypothetical protein  40.23 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  31.03 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  33.33 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3565  hypothetical protein  35.87 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  31.25 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2558  hypothetical protein  39.24 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5299  hypothetical protein  38.75 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.851605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3477  hypothetical protein  38.75 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  33.93 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6887  hypothetical protein  35.06 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13841  normal  0.0291889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3955  hypothetical protein  36.59 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  31.48 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  29.36 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  27.62 
 
 		 101 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5251  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.553187 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4607  hypothetical protein  29.21 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.391314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>