170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3346 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  56.07 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  37.72 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  40.22 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  34.82 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  32.74 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  35.59 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  35.09 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  34.69 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  41.49 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  31 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  33.9 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  35.78 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33.33 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.64 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  31.93 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  40.2 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  37.17 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  37.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  37.17 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  33.62 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  37.17 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  36.94 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  37.25 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  31.09 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  35.64 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  38.14 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  38.3 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  37.11 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  37.11 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  37.11 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  35.34 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  35.4 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  36.04 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  36.28 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  36.28 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  36.28 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  36.28 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  34.88 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  33.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  37.14 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  34.04 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  38.04 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  41.25 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  37.84 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  32.56 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  39.24 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  38.82 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.63 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  36.04 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  36.04 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  34.69 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  36.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  42.86 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  35.87 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  31.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  41.33 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  29.57 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  35.65 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  42.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  30 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  29.75 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  32.65 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  28.21 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  34.55 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.32 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  31.19 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  52 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  46.3 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  32.32 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  32.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  34.74 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  37.78 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  52 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  41.56 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.56 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  30.97 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  38.67 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  29.2 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>