141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1214 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  50.45 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  48.18 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  42.2 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  50.53 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  40.87 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  35.65 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  36.94 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  35.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  36.56 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  32.2 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  35.71 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  51.02 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  56 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  32.17 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  47.06 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  38.2 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  44.83 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  52.08 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  29.06 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  48.98 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  29.46 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  46.94 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  31.15 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  30.43 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  40.79 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  28.95 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  48 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  40.28 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  45.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  47.92 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  27.87 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  28.72 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  29.91 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  50.98 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  28.95 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  42.31 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  44 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  28.21 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  44.23 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  46.15 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  38.38 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  28.32 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  32.35 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  28.32 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  40.74 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  40.35 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  38.38 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  26.55 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  27.59 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  30.36 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  43.75 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  31.07 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  32.88 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  44 
 
 		 226 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  29.31 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  40.32 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  38.78 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  46 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  36.23 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  40 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  31.53 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  34.57 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  44.9 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  38.78 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  42.86 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  34.25 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  32.58 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  32.47 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  32.47 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  34.25 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  31.87 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  41.3 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  44.83 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  26.72 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  34.25 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  42.86 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  26.5 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  39.22 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>