221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1553 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  40.52 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  38.79 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  39.83 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  54.29 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  37.7 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  39.83 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  43.7 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  40.98 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  35.04 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  39.32 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  33.33 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  51.43 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  40 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  46.58 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  43.48 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  33.05 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  33.05 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  37.29 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  54.05 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  35.59 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  37.29 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  51.43 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  37.29 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  38.02 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  44.21 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  31.93 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  49.3 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  46.58 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  52.17 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  49.28 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  38.66 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  41.18 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  46.48 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  46.48 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  38.52 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  37.61 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  46.48 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  47.3 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  50.72 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  34.75 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  37.19 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  46.48 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  47.95 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  52.11 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  37.82 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  34.48 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  42.39 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  37.7 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  43.24 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  46.48 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  43.96 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  45.95 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  39.81 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  38.79 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  36.44 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  36.13 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  34.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  35.42 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  34.75 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  32.17 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  32.52 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36.07 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  36.67 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  51.39 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  29.41 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  36.21 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  35.25 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  35.83 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  41.76 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  31.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  39.44 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  35.29 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  34.96 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  47.89 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  34.45 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  47.83 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  48.61 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  32.2 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  45.21 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  45.21 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  45.21 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  34.45 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  40.28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  44.93 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  32.2 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  30.83 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  37.76 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>