265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2336 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  41.59 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  41.59 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  40.71 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  41.88 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  37.17 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  40.83 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  36.75 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  41.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  40.35 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  38.94 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  42.48 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.82 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  39.47 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  38.05 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  39.47 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  40.52 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  37.17 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  38.05 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  36.52 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  37.17 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  39.47 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  40.35 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  39.13 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  39.67 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  39.29 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  39.47 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  38.39 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  39.47 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  33.93 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  38.39 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  36.84 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  41.23 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  45.13 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  38.79 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  36.44 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  39.34 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.59 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  29.57 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  34.43 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  34.43 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  33.93 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  42.68 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  41.96 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  36.67 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  35.25 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  29.57 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  42.35 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  35.78 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  32 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  35.56 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  31.93 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  39.39 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  32.43 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  34.19 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  42.35 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0227  YCII-related protein  36.67 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  32.69 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  38.1 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  33.04 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  34.51 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  32.74 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  35.34 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  33.63 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  32.74 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  38.14 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  38.66 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  29.17 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  37.62 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  26.47 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  33.63 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  32.76 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  32.76 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  36.28 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  35.96 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  37.36 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  29.51 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  32.67 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  36.44 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  33.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  33.91 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  39.78 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  34.94 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  29.35 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>